Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr1d1Q3UV55 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms