Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx21Q3UR97 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms