Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fcho2Q3UQN2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcho2Q3UQN2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcho2Q3UQN2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcho2Q3UQN2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcho2Q3UQN2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms