Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms