Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap2Q3UND0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap2Q3UND0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms