Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lsg1Q3UM18 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms