Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc33Q3ULW6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms