Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rmdn3Q3UJU9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rmdn3Q3UJU9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms