Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3UJP5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3UJP5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms