Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sf3b2Q3UJB0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms