Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmod2Q3UHZ5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms