Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf44Q3UHJ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf44Q3UHJ8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms