Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mier3Q3UHF3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms