Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx27Q3UHD6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx27Q3UHD6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx27Q3UHD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx27Q3UHD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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