Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc58Q3UGP9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc58Q3UGP9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms