Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LbrQ3U9G9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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