Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U6N9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Q3U6N9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Q3U6N9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Q3U6N9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U6N9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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