Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U4G0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U4G0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U4G0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms