Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenplQ3U3S3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenplQ3U3S3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CenplQ3U3S3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.3 ms