Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms