Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud5Q3U2S4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud5Q3U2S4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms