Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Serac1Q3U213 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms