Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms