Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms