Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarca4Q3TKT4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarca4Q3TKT4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms