Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fubp3Q3TIX6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms