Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc13Q3TIR1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms