Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Treml4Q3LRV9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Treml4Q3LRV9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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