Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms