Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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