Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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Shroom4Q1W617 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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Shroom4Q1W617 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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Shroom4Q1W617 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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Shroom4Q1W617 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
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Shroom4Q1W617 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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Shroom4Q1W617 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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Shroom4Q1W617 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shroom4Q1W617 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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