Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam171bQ14CH0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam171bQ14CH0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms