Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms