Protein–RNA interactions for Protein: Q14B98

Fam109b, Sesquipedalian-2, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam109bQ14B98 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Fam109bQ14B98 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Fam109bQ14B98 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Fam109bQ14B98 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam109bQ14B98 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Fam109bQ14B98 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Fam109bQ14B98 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Fam109bQ14B98 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Fam109bQ14B98 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Fam109bQ14B98 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Fam109bQ14B98 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam109bQ14B98 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms