Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpusd3Q14AI6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpusd3Q14AI6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpusd3Q14AI6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rpusd3Q14AI6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rpusd3Q14AI6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd3Q14AI6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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