Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Spatc1Q148B6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Spatc1Q148B6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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