Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne7Q0VE82 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms