Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slc45a4Q0P5V9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc45a4Q0P5V9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms