Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrioQ0KL02 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms