Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2bQ0KL01 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms