Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cass4Q08EC4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cass4Q08EC4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms