Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssrp1Q08943 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms