Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kcnma1Q08460 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms