Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm3Q08189 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms