Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col9a2Q07643 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms