Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn3Q07409 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms