Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms