Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Aplp2Q06335 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aplp2Q06335 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms