Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprgQ05909 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprgQ05909 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms