Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apoc2Q05020 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms